江西省科學(xué)院創(chuàng)建于1958年，當(dāng)時為中國科學(xué)院江西分院，邵式平省長兼任院長，汪東興等十五人任副院長。1962年已經(jīng)擁有11個研究所(站)、全院職工近1000人。因歷史原因，1964年被撤消。

1978年全國科學(xué)大會后，江西省科學(xué)院于1979年7月重新組建，成為直屬于江西省人民政府的綜合性自然科學(xué)研究開發(fā)機構(gòu)。恢復(fù)建院以來，江西省科學(xué)院始終堅持以科研為中心，不斷提高科技創(chuàng)新能力，積極為國家和江西省經(jīng)濟(jì)社會建設(shè)服務(wù)，先后共取得科研成果600余項，其中獲省部以上獎勵60余項，獲國家科技進(jìn)步獎二等獎1項，國家自然科學(xué)獎三等獎1項，國家科技進(jìn)步獎三等獎1項，中國科學(xué)院科技進(jìn)步一等獎1項，農(nóng)業(yè)部科技進(jìn)步一等獎1項，省部級科技進(jìn)步二等獎15項。獲得國家發(fā)明專利50余項，發(fā)表學(xué)術(shù)論文1600余篇。上世紀(jì)80年代，江西省科學(xué)院組織了浩大的鄱陽湖多學(xué)科綜合科學(xué)考察，完成了88萬字的《鄱陽湖研究》學(xué)術(shù)專著和鄱陽湖地圖集，這項研究成果為我省通盤研究和綜合開發(fā)利用鄱陽湖提供了科學(xué)依據(jù)，為山江湖工程的開展奠定了基礎(chǔ)。