江西省科學院創建于1958年，當時為中國科學院江西分院，邵式平省長兼任院長，汪東興等十五人任副院長。1962年已經擁有11個研究所(站)、全院職工近1000人。因歷史原因，1964年被撤消。

　　1978年全國科學大會后，江西省科學院于1979年7月重新組建，成為直屬于江西省人民政府的綜合性自然科學研究開發機構。恢復建院以來，江西省科學院始終堅持以科研為中心，不斷提高科技創新能力，積極為國家和江西省經濟社會建設服務，先后共取得科研成果600余項，其中獲省部以上獎勵60余項，獲國家科技進步獎二等獎1項，國家自然科學獎三等獎1項，國家科技進步獎三等獎1項，中國科學院科技進步一等獎1項，農業部科技進步一等獎1項，省部級科技進步二等獎15項。獲得國家發明專利50余項，發表學術論文1600余篇。上世紀80年代，江西省科學院組織了歷史上較為浩大的鄱陽湖多學科綜合科學考察，完成了88萬字的《鄱陽湖研究》學術專著和鄱陽湖地圖集，這項研究成果為我省全面研究和綜合開發利用鄱陽湖提供了科學依據，為山江湖工程的開展奠定了基礎。

　　江西省科學院現有職工500余人，專業技術人才310人，博士102人，享受國務院特殊津貼19人，享受省政府特殊津貼7人，江西省跨世紀學科帶頭人2人、江西省新世紀百千萬工程人9人和贛鄱英才“555”工程領軍人才7人。省級優勢創新團隊4個;擁有4個國家平臺載體、12個省級重點實驗室和工程技術研究中心、1個院士工作站和1個省級重點智庫;主要在新材料、生物醫藥、節能環保、電子信息及智能制造等領域具備鮮明的技術優勢。

　　目前，江西省科學院擁有生物資源研究所、微生物研究所、能源研究所、應用化學研究所、應用物理研究所、科技戰略研究所、流域生態研究所7個研究所和高科技開發中心、計算機培訓中心、食品工程創新中心、低碳經濟研究中心和鄱湖陽研究中心5個研發中心。建有3個省級重點實驗室、4個省級工程技術中心。加入了銅冶煉及加工國家工程技術中心，硅基LED國家工程技術中心及中國再生資源產業技術創新戰略聯盟、中國海洋監測設備產業技術創新戰略聯盟和全國地方科學院聯盟。創辦了《江西科學》、《熱處理技術與裝備》、《生物化工》、《江西能源》四種學術期刊。江西省生態學會、江西省生物工程研究會、江西省能源研究會、江西省模具工業協會等學術團體掛靠在江西省科學院。

　　江西省科學院在生物工程、新材料、電子信息、精細化工、新能源、生態與環保、植物良種繁育等技術領域走在了我省技術研究的前列。江西省科學院還培育扶持了一批院、所參股控股的科技示范企業，涉及科技企業服務、生物、化工、新材料、電子信息、環保、教育培訓等領域。江西省科學院科技企業孵化器以江西省科學院為依托，充分發揮省科學院的成果、人才、學科、平臺等優質資源，以科技型中小企業和科技創業人員為服務對象，目前進駐30多家科技型企業，并申請了省級科技企業孵化器，努力打造省內一流的科技企業孵化器。

　　2012年3月，江西省人民政府與中國科學院在北京簽署了《江西省人民政府與中國科學院共建江西省科學院協議》，2017年1月，江西省政府與中科院簽署《全面戰略合作協議》，2018年5月，中科院審議通過與江西省政府共建“中國科學院江西產業技術創新與育成中心”，將我院帶入了新的重要發展時期。

　　在新的歷史時期，江西省科學院將深入實施“新時代12345”創新發展戰略，面向外科技革命與產業變革前沿、面向全省經濟社會發展重大需求、面向江西產業技術創新主戰場、明確主攻方向，集聚創新要素，著力打造江西省“產業技術研發中心、生態文明研究中心、科技成果轉移中心、創新戰略傳播中心”，努力建設成為國內一流的區域科技創新中心、重大產業技術策源地、高端科技人才集聚區、科技合作示范基地、重點高端科技智庫。